Hans Ulrik Riisgård arbeitete 6 Jahre lang (1977-1983) als Biologe für die Dänische Umweltschutzbehörde in der Abteilung für Meeresverschmutzung, wo er die Miesmuschel als Indikatororganismus nutzte um Studien zur Eutrophierung und Quecksilberbelastung im Limfjord durchzuführen. Er promovierte und habilitierte in den Jahren 1979 und 1982 an der Universität Kopenhagen. 1983 wurde er als Lektor an der Universität von Süddänemark (früher: Universität Odense) beschäftigt und hält seitdem Vorlesungen in Allgemeiner Ökologie und Meeresbiologie. Seit 2008 ist Hans Ulrik Riisgård Professor der Meeresbiologie und hat im Lauf der Jahre viele Bachelor-, Master- und Doktorarbeiten betreut. Seine Forschung umfasst in erster Linie filtrierende marine Invertebraten mit den Schwerpunkten Bioenergetik, Mechanismen zur Partikelaufnahme, Populationsfraßraten benthischer Filtrierer, Prädationsdruck von Quallen und Rippenquallen, Muscheln als Verschmutzungsindikatoren, Umweltprüfung und Aufnahme von Umweltgiften in das Nahrungsnetz. Neben seinem praktischen Engagement für Umweltangelegenheiten hat er mittlerweile über 160 wissenschaftliche Artikel in internationalen Zeitschriften und mehr als 50 populärwissenschaftliche Beiträge auf Dänisch veröffentlicht, die auf aktuelle Themen wie Ölverschmutzung, Schwermetallbelastung, Sauerstoffzehrung, Eutrophierung, die globale Erwärmung, den Rückgang der Ozonschicht oder das Massenauftreten von Quallen hinweisen.